因果关系鉴定应在具备合法资质的司法鉴定机构进行。诉讼中，当事人可向法院申请，由法院从司法行政部门公告的名册中通过摇号或指定确定机构。诉讼外，当事人可自行选择经省级司法行政部门登记、业务范围含因果关系鉴定的机构。
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关于因果关系鉴定的委托，《全国人民代表大会常务委员会关于司法鉴定管理问题的决定》第二条明确，从事法医类等司法鉴定业务的机构需登记管理，因果关系鉴定多属此类，应选择省级司法行政部门登记的机构。《司法鉴定程序通则》第十一条规定，鉴定机构统一受理办案机关委托，诉讼中法院委托或诉讼外自行委托，均需符合资质要求，以确保证明力。
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选择因果关系鉴定机构需注意法律风险：若选择无资质机构，鉴定结果可能不被法院采纳。例如，某人交通事故后自行委托无《司法鉴定许可证》的生物科技公司做因果关系鉴定，报告在诉讼中因机构无资质被对方异议，法院未采纳，导致其因证据不足败诉并遭受经济损失。
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为避免因果关系鉴定错误，需注意： 1、勿选无资质机构，此类鉴定意见可能因违法性不被法院采纳，浪费时间费用； 2、诉讼中自行委托鉴定应及时告知法院，否则可能引发对方异议及重新鉴定，增加诉讼成本； 3、避免选择业务范围不符的机构，如医疗因果关系鉴定应选法医临床类机构，而非物证类机构。若对选择存疑，可咨询我为您解答，助您规避风险，确保鉴定合法有效。

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